學校是國務院批準的首批碩士學位授予單位，第三批博士學位授予單位；現有10個博士學位授權一級學科，16個碩士學位授權一級學科，2個博士專業學位授權點，14個碩士專業學位授權點，8個博士后科研流動站，形成了以醫學為主，理學、工學、法學、管理學、教育學等多學科協調發展的學科體系。
臨床醫學、藥理學與毒理學入圍ESI全球前1‰，13個學科入圍ESI全球前1%，ESI總體排名位居全國第47。擁有5個國家重點及培育學科，6個國家中醫藥管理局重點學科，10個廣東省重點學科。擁有國家臨床重點專科27個（含中醫類）、廣東省臨床重點專科79個、廣東省高水平臨床重點專科35個。
學科建設基本情況一覽表
學科層次 | 學科名稱 |
ESI世界排名前1‰學科 | 臨床醫學、藥理學與毒理學 |
ESI世界排名前1%學科 | 臨床醫學、藥理學與毒理學、生物學與生物化學、神經科學與行為學、分子生物學與遺傳學、化學、免疫學、材料科學、微生物學、社會科學總論、農業科學、環境與生態學、精神病學與心理學 |
國家重點學科 | 人體解剖與組織胚胎學、內科學（消化系病）、中西醫結合臨床 |
國家重點(培育)學科 | 病理學與病理生理學、外科學（骨外） |
國家中醫藥管理局重點學科 | 中醫腎病學、中醫腦病學、中藥藥劑學、中醫痹病學、中藥藥理學、中西醫結合基礎 |
廣東省重點學科 | 基礎醫學、臨床醫學、中西醫結合、口腔醫學、生物醫學工程、生物學、公共衛生與預防醫學、藥學、社會醫學與衛生事業管理、護理學 |
博士學位授權一級學科 | 基礎醫學、臨床醫學、口腔醫學、公共衛生與預防醫學、中西醫結合、藥學、中藥學、護理學、生物學 、生物醫學工程 |
碩士學位授權一級學科 | 基礎醫學、臨床醫學、口腔醫學、公共衛生與預防醫學、中醫學、中西醫結合、藥學、中藥學、護理學、生物學、生物醫學工程、特種醫學、醫學技術、馬克思主義理論、公共管理、心理學 |
博士專業學位授權點 | 臨床醫學、口腔醫學 |
碩士專業學位授權點 | 臨床醫學、口腔醫學、電子信息、公共衛生、護理、藥學、中醫、中藥學、應用心理、應用統計、生物與醫藥、公共管理、翻譯、法律 |
博士后科研流動站 | 基礎醫學、臨床醫學、公共衛生與預防醫學 、中西醫結合、藥學、生物學、生物醫學工程、護理學 |
