張玉潤黨委書記
主持學校黨委全面工作。
黎孟楓黨委副書記 校長
主持學校行政全面工作。分管學校審計工作，分管審計處。
吳育蓮黨委副書記 紀委書記 省監(jiān)委駐南方醫(yī)科大學監(jiān)察專員
主持紀檢監(jiān)察工作，協(xié)管學校審計工作。分管紀檢監(jiān)察室，協(xié)管審計處。
張鍋紅黨委副書記
負責組織、統(tǒng)戰(zhàn)、宣傳、思政、文化建設、學生、就業(yè)、共青團、工會、教代會工作，分管黨委辦公室、黨委組織部（統(tǒng)戰(zhàn)部、機關黨委）、黨委宣傳部、黨委學生工作部（學生處、團委、就業(yè)指導中心）、工會。聯(lián)系生物醫(yī)學工程學院、護理學院、馬克思主義學院。
熊夢輝黨委常委 副校長
負責人事、財務、離退休、關工委、校友、教育發(fā)展基金會工作。分管人事處（黨委教師工作部）、財務處、離退休工作處、校友辦公室。聯(lián)系南方醫(yī)院。
楊海文黨委常委 副校長
負責總務后勤、基建、產(chǎn)業(yè)、科技轉化、順德校區(qū)、武裝保衛(wèi)、安全維穩(wěn)、依法治校、信息公開、保密、信訪工作。分管校長辦公室、保衛(wèi)處（武裝部）、基建處、總務處、順德校區(qū)管委會、廣東南方醫(yī)大資產(chǎn)經(jīng)營有限公司。聯(lián)系基礎醫(yī)學院、康復醫(yī)學院、珠江醫(yī)院、順德醫(yī)院。
劉叔文黨委常委 副校長
負責研究生教育與學位工作、發(fā)展規(guī)劃、學科建設。分管發(fā)展規(guī)劃處、研究生院（黨委研究生工作部）、圖書館。聯(lián)系藥學院、深圳醫(yī)院、深圳口腔醫(yī)院、深圳坪山醫(yī)院、深圳口腔醫(yī)院（坪山）、廣東省人民醫(yī)院。
馬 驪黨委常委 副校長
負責本專科生教育、八年制教育、留學生教育、繼續(xù)教育、國際交流與合作。分管教務處、國際交流與合作處、繼續(xù)教育學院、國際教育學院、通識教育部、教學發(fā)展中心。聯(lián)系檢驗與生物技術學院、外國語學院、皮膚病醫(yī)院。
王 冬黨委常委 副校長
負責醫(yī)院建設與發(fā)展、教職工和學生公費醫(yī)療/醫(yī)保、招投標、資產(chǎn)管理、設備與實驗室安全管理、檔案工作。分管醫(yī)院管理處、檔案館、招標采購中心、國有資產(chǎn)與實驗室管理部。聯(lián)系中醫(yī)藥學院、公共衛(wèi)生學院、衛(wèi)生管理學院、中西醫(yī)結合醫(yī)院、第五附屬醫(yī)院、第七附屬醫(yī)院。
趙 鎮(zhèn)黨委常委 副校長
負責科技、人才、智慧校園建設、學報與雜志工作。分管人才工作辦公室、科研院、網(wǎng)絡中心、學報編輯部、實驗動物管理中心、中心實驗室。聯(lián)系法醫(yī)學院、第三附屬醫(yī)院、口腔醫(yī)院、第十附屬醫(yī)院（東莞市人民醫(yī)院）。
